After que, the mood often depends on how sure you are. Certainty takes the indicative; doubt and possibility take the subjunctive:

Certain → indicative	Uncertain → subjunctive
Sei que ela está em casa.	Duvido que ela esteja em casa.
Tenho certeza de que ele vem.	É possível que ele venha.
Acho que você tem razão.	Não acho que você tenha razão.

• Acho que (I think) states your view, so the indicative is the normal choice: Acho que vai chover.
• Não acho que turns it into doubt, and the standard form after it is the subjunctive.
• É possível que and pode ser que (it may be that) take the subjunctive.
• Unlike quero que, duvido que works about yourself too: Duvido que eu consiga. — I doubt I'll manage.
• In speech, tenho certeza que without de is very common.

Here is estar after que: que eu esteja, que você esteja, que nós estejamos, que vocês estejam.